Його звинувачують у причетності до убивства мера міста Нєфтєюганськ. Про це сказав представник Слідчого комітету Росії Володимир Маркін.
Ходорковського також оголосили у міжнародний розшук, він перебуває за межами Росії та відкидає висунуті звинувачення.